Vizita Patriarhului Kirill la Universitatea de Inginerie Fizică MIFI a provocat un scandal neașteptat, unii dintre studenți protestând față de faptul că, înainte de vizita acestuia, în curtea MIFI, la intrare, a fost instalată o cruce, iar pentru participarea la întâlnire, cursurile au fost întrerupte.
Studenții care au reacționat, au susținut că aceste lucruri nu ar trebui să se întâmple într-o universitate laică, și într-o țară în care funcționează principiul libertății conștiinței, mai ales că biserica este separată de Stat.
După întronizarea lui Kirill în fruntea Bisericii Ortodoxe Ruse, misionarismul în rândul tinerilor a crescut în intensitate. S-ar părea că manifestarea din prezent este o reacție naturală a unor tineri studenți față de această atitudine, apreciază presa locală.

În plus, s-ar părea că au existat și unele conflicte de ordin teologic în cadrul discuțiilor avute atât cu credincioșii cât și cu cei atei. Dezbaterea ar fi avut trei teme importante cărora Patriarhul trebuia să le răspundă: dacă păcatul ajunge până în centrul atomului, dacă găurile negre și antimateria sunt demonice și cum să ne protejam de “mizeria de pe internet”.

Se pare că, deranjantă, a devenit și atitudinea cadrelor universitare față de Patriarh, care a fost primit precum un înalt funcționar de Stat, studenții refuzând ca cei de la conducerea Universității să le impună un “format religios”. Cu toate acestea, conducerea remarcă faptul că Biserica se apropie mult de Stat, deci și ierarhia ei de înalții funcționari.