Mănăstirea Sfântul Ștefan este cea mai veche așezare monahală de pe Muntele Meteora, fiind fondată în anul 1192 de către sihastrul Ieremia. În anul 1333, Andronic al III-lea Paleologul a renovat-o, luând-o sub protecția sa. 

Biserica veche cu hramul Sfântul Arhidiacon Ștefan a fost construită în anul 1350, dar ulterior devenind neîncăpătoare, s-a mai construit o biserică mare (1798) cu hramul Sfântul Haralambie. 

Din anul 1961 mănăstirea a fost transformată în chinovie de călugărițe. 

Muzeul mănăstirii adăpostește numeroase și prețioase obiecte de cult. Aici poate fi văzut un codex bizantin din anul 1404, donat de Filotei și Antonie Cantacuzino.