Expoziția muzeului de la Mănăstirea Nea Moni este găzduită într-o clădire situată la nord-vest de biserica principală a mănăstirii. Expoziția găzduiește lucrări de argintărie ecleziastică și seculară, broderii, textile țesute, precum și icoane religioase datând din perioada cuprinsă între secolele al XVII-lea și al XIX-lea. Exponatele prezentate la muzeu sunt toate donații, deoarece bogata și valoroasa colecție a mănăstirii nu a fost păstrată din cauza jafurilor suferite în secolul al XIX-lea.