Săvârșind călătoria acestei vieți și cunoscând dinainte sfârșitul său, și-a dat fericitul său suflet în brațele lui Hristos în primăvara anului 1789, la 29 martie, în zilele sărbătorii Învierii Domnului și a fost înmormântat. După unele semne și minuni săvârșite de Sfântul Cuvios Onufrie, în anul 1846 i-au fost dezgropate osemintele sfinte, care până în ziua de astăzi se păstrează în mănăstirea Sihăstria Voronei.