Spre deosebire de alte mănăstiri care au fost construite în apropierea unei vetre monahale mai vechi, Mănăstirea „Sfânta Treime” – Eşanca a fost întemeiată în incinta unei biserici parohiale, construită în prima jumătate a secolului trecut.
Piatra de temelie a noii biserici a fost pusă la 20 iulie 1998 de către Preafericitul Daniel, Patriarhul Bisericii Ortodoxe Române, pe atunci Mitropolit al Moldovei şi Bucovinei.