Mănăstirea Bodbe a fost ridicată pe mormântul Sfintei Nina la dorinţa regelui Mirian III (284-361). Biserica iniţială de tip navă a fost încorporată în basilica cea mare, cu trei abside, ridicată după secolul al IX-lea. În secolul al XVII-lea, bisericii i-a fost adăugată o prelungire, primind un aspect de clădire fortificată.