Biserica actuală a Mănăstirii „Sfântul Ioan cel Nou de la Suceava” a fost începută în 1514 de către fiul lui Ștefan cel Mare, Bogdan al III-lea cel Orb, și terminată de fiul lui Bogdan, Ștefăniță, în anul 1522. În biserică se păstrează moaștele Sfântului Ioan cel Nou, martirizat în Cetatea Albă (la sud de Republica Moldova, în Ucraina de azi) pe la anul 1332.