Sfântul Ignatie s-a născut în 1492, în satul Faranga din Mitileni (lângă localitatea Kalloni). Tatăl său, Emmanuel Agallianos, a fost preot în Mitilini, descendent al unei mari familii din Constantinopol.  

Tânărul Ioan s-a căsătorit și a fost hirotonit preot în localitatea Sakellionos.

În acea perioadă, pe insulă a avut loc o epidemie puternică. Soția și copiii lui au murit, cu excepția unui singur copil, care mai târziu s-a călugărit cu numele Metodie și a continuat munca tatălui său. După epidemie, Sfântul Ignatie s-a retras pe locurile natale, ctitorind Mănăstirea Limonas, în anul 1526. În anii ocupației turcești a insulei, a oferit un sprijin neobosit creștinilor în acele încercate vremuri.

A slujit ca stareț al mănăstirii până în anul 1530, pentru că în 1531, pe când se afla la Constantinopol, a fost ales Mitropolit de Mitimna.

La sfârșitul anului 1563, Sfântul Ignatie a cerut să se retragă din funcția de mitropolit pentru a-și petrece restul vieții ca și călugăr în mănăstire. A adormit în Domnul în data de 14 octombrie 1566.