Kathisma Sfântului Trifon se află în apropierea fânăriei de pe platoul inferior, pe partea de nord a caldarâmului ce coboară către grădinile din partea de vest a mănăstirii Vatoped.

Este o construcție cu două etaje, al cărei parter dispune de spații de depozitare, iar etajul cuprinde biserica și spații de locuit. Clădirea dispune de un pridvor deschis (hagiat[1]) pe laturile de nord și de vest, sprijinit pe piloni.

Biserica a fost construită în anul 1882, conform datei înscrise pe peretele său estic.

An de an, la 1 februarie, ziua pomenirii Mucenicului Trifon, obștea mănăstirii Vatoped merge în procesiune la Kathisma Sfântului Trifon, unde se face slujba mică de sfințire a apei în pridvorul paraclisului. La acest moment este adusă și racla cu mâna dreaptă a Sfântului Mucenic și Doctor fără-de-arginți. La rugăciunile de la aghiasmă se adaugă încă două rugăciuni: cea a Sfântului Trifon și cealaltă a Sfântului Nicodim Aghioritul către Mucenic.