Particularitatea bisericii Mănăstirii Războieni e ridicarea ei pe oseminte de eroi; ea este necropolă, este monument istoric și mausoleu, în același timp. În cripta comună de la temelia lăcaşului au fost găsite schelete fără cranii. Se consideră că acești eroi sunt oștenii lui Ștefan cel Mare, care au fost decapitați de către turci, cerându-li-se înainte să se lepede de credința ortodoxă. Din tradiție se spune că ale lor cranii lor ar fi undeva sub sfânta masă, pentru o cinstire mai mare. Iată de ce biserica are caracter comemorativ. Biserica este micuță şi austeră. Probabil că Ștefan cel Mare nu a pictat-o pentru simplul motiv ca cel care se reculege în această biserică să se poată concentra mai bine asupra tragicului moment de la 1476.