Părintele Iosif a condus obștea de la Vatoped de la venirea de la Nea Skiti, în anul 1988, până în anul 1990, când această ascultare a fost încredințată Părintelui Efrem Vatopedinul.

Odată slobozit de grija stăreției, părintele Iosif Vatopedinul s-a retras la Chilia Sfinții Doctori fără de arginți Cosma și Damian. Aici primea ucenicii pentru spovedanie și sfaturi duhovnicești.

În ultima parte a vieții, fiind neputincios, părintele Iosif Vatopedinul a fost îngrijit de unul dintre părinții din obștea Vatopedului.

Părintele Iosif a trecut la Domnul în dimineața zilei de 1 iulie 2009, la vârsta de 88 de ani, chiar în ziua de prăznuire a Sfinților săi ocrotitori, Cosma și Damian, zi în care s-a și născut.

După trecerea sa la cele veșnice, Părintele Iosif Vatopedinul a zâmbit vreme de aproape o oră.

Astăzi, la Chilia „Sfinții Doctori fără de arginți Cosma și Damian” viețuiește ucenicul părintelui Iosif Vatopedinul.

În toamna anului 2014 am avut binecuvântarea de a participa, alături de un grup de tineri, la Sfânta Liturghie săvârșită în paraclisul chiliei. După slujbă, am fost serviți cu o kerasmă, fiecare așezându-se în câte un colț al camerei. De îndată, părinții ne-au spus că cei ce au stat pe scaunul părintelui Iosif Vatopedinul au devenit monahi mai târziu.

(Foto) Pași de pelerin la Chilia „Sfinții Doctori fără de arginți Cosma și Damian” – Vatoped, Athos