După tradiție, Cuviosul Nectarie, ctitorul mănăstirii, s-a dus în anul 1545 la Constantinopol, la patriarhul de atunci, Partenie, că să închine Mănăstirea Varlaam ca stavropighie. Cu acea ocazie, Patriarhul ecumenic a dăruit Mănăstirii Varlaam mâna stângă a Sfântului Ioan Hrisostom și capul Sfântului Nou Mucenic Ioan de Ioanina.

De atunci și până astăzi, sfintele moaște au rămas în tezaurul Mănăstirii Varlaam ca niște odoare de mare preț. În ziua de pomenire a Sfântului Ioan Gură de Aur, la Mănăstirea Varlaam se săvârșește slujbă de priveghere, la care participă mulțime de monahi și pelerini.

În luna octombrie a anului 2007, la Iași a fost adusă mâna stângă a Sfântului Ioan Gură de Aur – cu prilejul hramului Sfintei Cuvioase Parascheva. Delegația greacă a fost condusă de vrednicul de pomenire Înaltpreasfințit Serafim, Mitropolitul de Stagon și Meteora (†18 martie 2017).