Colina Karyes din Thermi, Insula Lesvos este locul unde astăzi este așezată Mănăstirea „Sfântul Mucenic Rafail”. Denumirea de „Karyes” vine de la mulțimea asceților ce se nevoiau aici. O parte dintre acești călugări sihaștri au fost ucenici ai Sfântului Ierarh Grigorie Palama, arhiepiscopul Tesalonicului.  Aici a existat o mănăstire de călugări la început, iar mai apoi una de maici. Mănăstirea a fost distrusă de pirați în anul 1235, pe 11 mai. Maicile din mănăstire, în numar de 30, au avut mult de suferit de pe urma cruzimii păgânilor. Maica Olimpia a primit moarte martirică. După acest eveniment, locul a ramas ruinat.

În anul 1433, mănăstirea ruinată va fi rezidită de către o creștină din parțile locului, pe numele ei Melpomena, împreuna cu familia ei. Tot aici, călugării mănăstirii au deschis un azil de bătrâni și o cantină pentru săracii din zonă. Ultimul stareț al mănăstirii a fost Sfântul Rafail, martirizat de către turci, în anul 1463, împreună cu alți creștini. Atunci mănăstirea a fost din nou distrusă, fiind incendiată în întregime. A fost voia Domnului ca sfintele moaște să fie aflate după aproape 500 de ani, iar descoperirea lor să se facă chiar sub îndru­marea sfinților mucenici. Ei s-au arătat în vise sau vedenii unor oameni credincioși cărora le-au des­­coperit mucenicia lor, dar și unde tre­buiau să sape ca să găsească urme ale sfintei mă­năs­tiri.

Actuala mănăstire a fost construită sub îndrumarea Maicii Starețe Evghenia, ce a venit pentru prima dată pe Colina Karyes în data de 27 martie 1964, la rugămintea Mitropolitului Iocov al II-lea al Mitilenei, precum și a arătării Sfântului Rafail, spunându-i că ea va fi cea care va trebui să construiască mănăstirea sa. Și-a început lucrarea într-un cort. A scris numeroase cărți premiate la nivel internațional (170 cărți). Cărțile ei au fost singura sursă de venit pe care Maica Stareță a folosit-o pentru construirea mănăstirii și pentru activitățile sale filantropice.