Vechimea Sfintei Mănăstiri Lainici se pierde în negura vremii, necunoscându-se oficial și istoric începuturile sale. După tradiție, în secolul al XIV-lea Sfântul Nicodim de la Tismana a fost trimis în Țara Românească pentru a susține Ortodoxia și pentru a da un suflu nou bisericii. El s-a așezat într-o peșteră lângă Mănăstirea Lainici. Tot Sfântul Nicodim a ctitorit mănăstirea Vodița de lângă Drobeta Turnu Severin și Mănăstirea Tismana, în preajma căreia a sihăstrit până la sfârșitul vieții sale. Importanța așezământului a fost sesizată și de împărăteasa Maria Tereza, care, prin generalul Bukow, a distrus între 1750-1765 (în 15 ani) sute de așezăminte ortodoxe în Transilvania. Schitul, deși nu era în Imperiul Austro-Ungar, aflat la câțiva kilometri de graniță, a căzut victima marii prigoane antiortodoxe a puterii imperiale de la Viena. Biserica ctitorită din sec. XIV-lea – al XV-lea ar fi fost distrusă în acea perioadă.