Mănăstirea Stavronikita este construită pe o stâncă de lângă mare, situată pe ţărmul de nord-est, la jumătatea peninsulei, între Mănăstirea Pantocrator şi Mănăstirea Iviron. Deşi cea mai nouă şi cea mai mică mănăstire athonită, Stavronikita este a cincisprezecea în ierarhia athonită.