Mănăstirea Makrimallis adăpostește cea mai mare parte a Capului Sfântului Partenie al Lampsacului, cunoscut pentru vindecările de cancer și alte boli incurabile, precum și pentru izgonirile demonilor.

Între odoarele mănăstirii se numără și cinstitul cap al Sfintei Mucenițe Paraschevi și părticele din moaștele Sfântului Ioan Botezătorul și ale Sfinților Haralambie, Pantelimon, Nichita și alții.

De asemenea, în biserica principală este așezată spre închinare icoana făcătoare de minuni a Maicii Domnului, prăznuită pe 23 august, la Odovania Praznicului Adormirii Maicii Domnului.

Aceste sfinte moaște, împreună cu icoana făcătoare de minuni a Maicii Domnului, au fost salvate în chip miraculos după ce mănăstirea a fost distrusă în 1944 în timpul ocupației germane.