Întemeiată încă din timpul Sfântului Constantin cel Mare, Mănăstirea Vatoped a fost distrusă şi refăcută de mai multe ori, de-a lungul istoriei. După incendierea ei de către piraţii arabi, la începutul veacului al X-lea, este refăcută de trei nobili bizantini trimişi aici de către Sfântul Atanasie Athonitul, astfel că prima atestare documentară o avem de la 985, când apare semnătura stareţului Mănăstirii Vatoped într-un document al protosului Sfântului Munte. Din acea vreme şi până astăzi, Lavra Vatopedului ocupă al doilea loc în ierarhia mănăstirilor athonite, după Mănăstirea Marea Lavră.